荧光假单胞菌是一种重要的植物根际促生剂，大部分能防病增产，因此可用于植物病害的生物防治。
荧光假单胞菌的产生是其抑制植物病害的重要因素。可预防青枯病、软腐病、小麦全蚀病、枯萎病、枯萎病等多种土传病害，减少病害的发生。此外，荧光假单胞菌还能产生生长素物质，促进作物根系生长，解决根腐病问题。针对近年来小麦主产区突发全蚀病的问题，“全蚀净”结合“荧光假单胞菌”拌种防治全蚀病在河南取得了较好的效果。
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