(1)体壁和体腔。蚯蚓体外有一层薄薄的一层叫角质层，分为内皮层和外皮层。外侧为体壁层，内侧为内脏壁层。这两层之间有一个很大的空间，称为体腔。体壁由外侧环肌、内侧纵肌和体腔膜组成皮肤肌囊。内脏壁层由外侧的纵肌、内侧的环肌和体腔膜组成，使蚯蚓保持一定的体形。肠壁外和背侧血管周围有黄色细胞，储存脂肪、蛋白质和糖原。它们还具有部分排泄功能，氨和尿液从这里清除出去。体腔内有体腔液、生殖器官、血管和神经素。
(2)消化系统。蚯蚓的消化系统就像一根长管。消化道的前端是口腔，包括口腔前叶和口腔。它没有牙齿和上颚，有发达的纵向肌肉，适合挖土。嘴里有嗅觉和味觉器官，可以帮助寻找食物和躲避敌人。咽呈梨形。由于咽部肌肉的收缩和舒张，喂食时口腔壁外翻，具有一定的吸吮作用。咽下面是细长的食道，两侧有石灰腺。食道后端有一个嗉囊，是暂时储存食物和初步消化食物的地方。嗉囊后端有肌胃，壁厚，肌肉发达，可磨碎食物。砂囊后面是胃和长肠，直肠的开口是肛门。食物的消化和吸收主要在小肠完成。
(3)循环系统。蚯蚓有完整的循环系统。它们有几对有节奏地跳动的管状“心脏”，可以控制血液按一定方向流动，并有防止血液回流的心脏瓣膜。另外，蚯蚓的身体布满了大大小小的血管，主要有背侧血管、腹侧血管、食管外侧血管、神经下血管等。血管输送营养物质和氧气并带走代谢产物，包括各种废物和二氧化碳。
(4)呼吸系统。蚯蚓身体的表皮下，有密集的毛细血管网。通过渗透作用，溶解在体表粘液中的氧气进入毛细血管，毛细血管中的二氧化碳通过湿润的皮肤释放出来。蚯蚓进行气体交换时，其体表必须保持湿润，因为只有气体溶解在液体中才能发生气体交换。
(5)排泄系统。蚯蚓有后肾管，通向体腔的漏斗，称为肾造口，并与螺旋状肾管相连，分布在体腔肠道的一侧。每根肾管在体腔内都有一个开口，在体内剧烈盘旋，然后通过肾管孔通向体外。新陈代谢产生的各种废物通过肾管排出体外。
(6)神经系统。蚯蚓有集中的绳状神经。主要包括中枢神经系统、周围神经、交感神经，有简单的反射弧。皮肤上的感受器收到的任何刺激，都会通过腹神经索将冲动传递到反应器，并做出相应的动作。蚯蚓没有听觉，但对振动和光很敏感。
(7)生殖系统。蚯蚓是雌雄同体。男性生殖器官包括精囊、睾丸和输精管，女性生殖器官包括卵巢、卵囊和输卵管。输精管的外部开口是男性口，输卵管的外部开口是女性口。
蚯蚓排卵时，纤维环肿胀变色，纤维环上皮细胞分泌大量分泌物，在纤维环周围形成圆柱形卵袋，卵袋内含有大量白色粘稠蛋白液。此时卵子从雌孔排出，进入蛋白液中。排卵后，蚯蚓后退，卵袋向身体前方移动。当它穿过受精囊孔时，精子从受精囊排出并发生受精。此时，卵袋（卵茧）从头端脱落，分泌粘液封住袋口，残留在土壤中。在适宜的温度和湿度条件下，受精卵继续发育，最终孵化成小蚯蚓。刚孵化出来的小蚯蚓是白色的，然后逐渐变成浅粉色，直到颜色变深，最后长成成熟的蚯蚓，然后继续繁殖后代。
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